刘文典（1928年4月-1929年1月）

程天放（1929年1月-1929年6月）

王星拱（1929年6月-1930年6月）

杨亮功（1930年6月-1931年6月）

何鲁（1931年6月-1932年4月）

程演生（1932年4月-1934年1月）

傅铜（1934年1月-1934年7月）

李顺卿（1934年7月-1938年3月）

陶因（1946年9月-1948年7月）

杨亮功（1948年7月-1949年4月复任国立安徽大学校长）

许杰（1949年10月-1954年2月）

曾希圣(1958年9月-1962年3月以安徽省委第一书记兼任安徽大学校长)

张行言（1962年3月-1966年10月任安徽大学校长；1973年2月-1978年12月任安徽大学革委会主任）

杨枫（1978年12月-1979年1月）

孙陶林（1979年1月-1983年10月）

刘永生（1983年10月-1987年7月    任安徽大学副校长，主持行政工作）

杜宜瑾（1987年8月-1997年4月）

黄德宽（1995年任安徽大学副校长；1997年任副校长、党委副书记，主持行政工作；2000年-2010年1月任安徽大学校长）

程桦(2010年1月-2017年3月)

项 南（1951年-1953年2月）

张行言（1958年6月-1966年10月任中共安徽大学党委书记兼副校长；1977年9月-1983年10月复任安徽大学党委书记）

  陆勤毅（2003年6月-2009年6月）

  黄德宽（2009年7月-2014年7月）

李仁群（2014年7月-2019年8月）